L'Archivio Storico dell'Eremo e Monastero di Camaldoli, attualmente ubicato nei locali del Monastero di Camaldoli, ha una consistenza di 1821 volumi, 166 cassette e 1791 pergamene.
Si tratta di un complesso archivistico costituito da vari fondi, successivamente confluiti a Camaldoli, a seguito delle varie e tormentate vicende storiche che hanno interessato la Congregazione Camaldolese dell'Ordine di San Benedetto.
Il patrimonio archivistico è costituito, oltre che dalla documentazione prodotta dagli eremi e monasteri della Congregazione Camaldolese di Toscana (Eremiti), che storicamente ebbe la sua sede presso l'Eremo e Monastero di Camaldoli, anche da quella proveniente da vari monasteri appartenuti un tempo alla Congregazione Camaldolese di San Michele di Murano (Cenobiti), unita alla Congregazione toscana nel 1935 con la costituzione apostolica Inter religiosos coetus di Pio XI del 2 luglio 1935. Da questa fusione sorse la "Congregazione dei Monaci Eremiti camaldolesi dell'ordine di San Benedetto".

Lo stato attuale dell'Archivio è in gran parte il risultato dell'ordinamento operato dall'archivista don Giuseppe Cacciamani tra il 1970 e il 1977. All'epoca l'Archivio si trovava ancora presso l'Eremo, nella cella dell'Immacolata Concezione, già cella del duca di Parma. Nel 1984 venne trasferito al cenobio di Camaldoli.

E' possibile ricostruire il lavoro di ordinamento svolto dal Cacciamani grazie ad una serie di strumenti di corredo da lui compilati, costituiti da nove volumi di Indici manoscritti segnati con lettere alfabetiche dalla A alla I, da una Guida per l'Archivio del Sacro Eremo di Camaldoli dattiloscritta, relativa alle cosiddette "Carte sciolte", cioè la parte dell'Archivio conservata in fascicoli raccolti in cassette (in seguito Guida per l'Archivio), e da due volumi di indici manoscritti relativi alla "Fototeca" e alla sezione "Agiografia camaldolese": tali volumi saltuariamente contengono anche indicazioni cronologiche riferite alle varie fasi del lavoro.

Nell'ordinare l'Archivio di Camaldoli don Giuseppe Cacciamani non seguì il principio del metodo storico e della provenienza dei fondi, adottando piuttosto un ordinamento "classificatorio" per materia. Questo è particolarmente evidente nella sezione delle "Carte sciolte", dove è stata completamente ignorata la originaria appartenenza delle carte. L'archivio "cartaceo" presenta infatti una distinzione fra materiale rilegato in "Volumi" e "Carte sciolte", che si può fare risalire al Cacciamani; l'archivista inventariò separatamente i "Volumi" (indicati come "Manoscritti" negli Indici suddetti) dalle "Carte sciolte" (illustrate dalla Guida per l'Archivio), che raccolse in cassette.

Tutto il materiale è descritto in una serie di elenchi analitici compilati dall'attuale archivista don Ugo Fossa.
Il materiale archivistico è organizzato in tre grandi partizioni:
"Fondo diplomatico", "Volumi" e "Carte sciolte".

I. Fondo Diplomatico, 1791 pezzi, sec XI - XVIII Camaldoli, pezzi 881, di cui 877 del "diplomatico" (1060 - 1637) e 4 del Bullarium (1138 - 1486) S. Michele di Murano (Venezia), pezzi 255, di cui 163 del "diplomatico" (1099 - 1675) e 92 del Bullarium (1228 - 1805) Ss. Ippolito e Lorenzo di Faenza (Ravenna), pezzi 456, di cui 439 del "diplomatico" (1022? - 1791) e 17 del Bullarium (1260 - 1604) Ss. Vito e Lucia di Vicenza, pezzi 58, di cui 52 del "diplomatico" (1207 - 1609) e 6 del Bullarium (1335 - 1525) S. Maria di Follina (Treviso), pezzi 136, di cui 135 del "diplomatico" (1155 - 1651) e 1 del Bullarium (1219) Certosa di Pontignano (Siena) pezzi 5 del "diplomatico" (1638 - 1699)

II. Volumi, 1821 pezzi, sec XIII - XX Eremo e Monastero di Camaldoli, pezzi 270, sec XIII - XX Mausolea, pezzi 456, sec XVIII - XX S. Gregorio al Celio (Roma), pezzi 43, sec XVII - XX Procura di S. Romualdo (Roma), pezzi 161, sec XVIII - XX S. Michele di Murano, pezzi 490, sec XV - XIX in Abate Giuseppe Zuppani (segnatura provvisoria "UL"), pezzi 81, sec XVIII - XX Badia di Buonsollazzo (Borgo San Lorenzo, Firenze), pezzi 160, sec XVIII - XX Parrocchia di S. Clemente della Tassaia (Borgo San Lorenzo, Firenze), pezzi 43, sec XVIII - XX Ss. Ippolito e Lorenzo di Faenza (Ravenna), pezzi 22, sec XVIII - XX S. Maria degli Angeli di Firenze (antica), pezzi 58, sec XVI - XIX S. Maria degli Angeli di Firenze (nuova), pezzi 21, sec XIX - XX Procura degli Eremiti di Toscana (Roma), pezzi 15, sec XVIII - XIX S. Croce di Sassoferrato (Ancona), 1 pezzo, "Amministrazione del Monastero di S. Croce di Sassoferrato", 1903-1915

III. Carte sciolte, cassette 166, sec XVI - XX sezione A : Atti dei priori generali della Congregazione di S. Michele di Murano, cassette 32, (sec XVII - XX) sezione B : Atti dei priori generali del Sacro Eremo di Camaldoli, cassette 20, (sec XVII - XX) sezione C : Monache camaldolesi, cassette 2, (sec XX) sezione D : Congregazione del Sacro Eremo di Camaldoli, Procura Generale di Roma, cassette 3, (sec XVII - XX); e documentazione relativa ai Capitoli Generali, cassette 2, (sec XVIII - XX) sezione E : Congregazione del Piemonte - Atti Capitolari e dietali, cassetta 1, (1692 - 1794) sezione F : Congregazione di S. Michele di Murano: Procura Generale di Roma, cassette 3, (sec XVII - XX); Raccolte di Atti di Capitoli Generali e Diete, cassette 3, (sec XVI - XX) Cassette 1 - 18: Camaldoli, (sec XVI - XX) Cassette 19 - 37: S. Maria degli Angeli di Firenze (antica), (sec XVI - XIX) Cassette 38 - 39: S. Maria degli Angeli di Firenze (nuova), (sec XIX - XX) Cassetta 40: Ss. Giusto e Clemente di Volterra (Pisa), (sec XIX); S. Francesco di Volterra (Pisa), (sec XIX - XX); Comunità di San Gimignano (Siena), (sec XIX); S. Maria in Gradi di Arezzo, (sec XVIII - XIX) in.; S. Niccolò di Sansepolcro, (sec XVIII - XIX) in.; S. Maria delle Vertighe (Arezzo), (sec XIII - XIX); S. Maria della Rosa di Siena, (sec XIX) in Cassetta 41: S. Egidio di Cortona (Arezzo), (sec XVIII - XX); S. Maria di Poppiena (Arezzo), (sec XVII); Eremo Nuovo (Forlì), (sec XIX); Cella S. Alberigo (Forlì), (sec XVII - XIX); Eremo di Monte Celso (Siena), (sec XVIII); Valle Benedetta (Livorno), (sec XVIII - XIX); S. Trinità della Fontana (Mantova), (sec XVIII), Eremo di Tizzano (Bologna), (sec XIX) Cassetta 42: S. Maria in Bagno di Romagna (Forlì), (sec XVII - XX); S. Giovanni Battista di Faenza, (sec XVIII) Cassetta 43: Eremo di Scardavilla (Forlì), (sec XVIII - XIX); Eremo di S. Tecla (Genova), (sec XVIII) Cassetta 44: S. Salvatore di Forlì, (sec XVIII - XX) in Cassetta 45: Ss. Ippolito e Lorenzo di Faenza (Ravenna), (sec XVIII - XX) Cassetta 46: Ss. Ippolito e Lorenzo di Faenza, (sec XVIII - XX); S. Apollinare in Classe (Ravenna), (sec XIX); S. Lucia di Vicenza, (sec XVIII) Cassette 47 - 54: S. Gregorio al Celio di Roma, (sec XVII - XX) Cassetta 55: S. Croce di Sassoferrato (Ancona), (sec XIX - XX); Ss. Lorenzo e Angelo del Massaccio (Ancona), (sec XIX - XX); Eremo delle Grotte (Ancona), (sec XX) Cassetta 56: S. Maria degli Angeli di Pesaro, (sec XVII - XIX); S. Agostino di Basciano (Teramo), (sec XIX) Cassette 57 - 59: S. Angelo Magno di Ascoli Piceno, (sec XVIII - XIX) Cassette 60 - 61: S. Biagio di Fabriano (Ancona), (sec XIX - XX); S. Severo di Perugia, (sec XIX - XX) Cassette 62 - 63: S. Pietro di Gubbio (Perugia), (sec XIX - XX); S. Croce di Sassovivo (Perugia), (sec XIX) Cassetta 64: S. Maria di Sitria (Perugia), (sec XIX) Cassetta 65: S. Michele di Murano (Venezia), (sec XVIII - XIX) Cassetta 66: S. Michele di Murano (Venezia), (sec XVI - XIX); S. Maria di Follina (Treviso), (sec XVIII - XIX); Ss. Cristina e Parisio di Treviso, (sec XVIII - XIX); S. Maria della Vangadizza (Rovigo), (sec XIX - XX) Cassetta 67 A-C: Galanoli (Nuoro), (sec XX) Cassetta 68: Nôtre Dame de Pitié (Rocquebrune), (sec XX); Casa di Cannes, (sec XVIII); Principato di Monaco, (sec XIX) Cassetta 69: Nuova Camaldoli (Brasile), (sec XIX - XX) Cassetta 70: New Camaldoli (USA), (sec XX); Saccidananda Ashram (India), (sec XX) Cassette 71 - 93: La Mausolea (Arezzo), (sec XVII - XX) Cassette 94 - 95: Badia di Buonsollazzo (Firenze), (sec XVIII - XX) Cassetta 96: S. Croce di Fonte Avellana (Pesaro e Urbino), (sec XVIII - XX) Cassetta 97: S. Salvatore di Monte Giove (Pesaro e Urbino), (sec XX) Cassetta 98: S. Elena di Onigo (Treviso), (sec XX) sezione H: "Professioni e documenti personali", cassette 1 - 3 sezione I: A) "Agiografia camaldolese", cassette 1-8, B) "Agiografia non camaldolese", cassetta 1 sezione J: "Miscellanea monastica", cassette 1-10. Comprende cronache, notizie storiche su diversi monasteri, serie di superiori dell'ordine, corrispondenza, fotocopie ed estratti di documenti conservati in altri archivi, vario materiale librario (le cassette 4-5 dedicate a Gregorio XVI; 6-7 ai Benedettini, 8 agli Olivetani, 9 ai Coronesi, 10 alla "Confederazione benedettina")

Per l'accesso al patrimonio archivistico, sono disponibili inventari cartacei consultabili presso la sala cataloghi della biblioteca del monastero di Camaldoli.
L'archivio è aperto tutti i giorni feriali con il seguente orario:
09.00 - 12.00   /  14.00 - 18.00
Su richiesta si può accedere anche nei giorni festivi.